Розробка під лінукс зараз не є чимось дуже специфічним (дякуючи серверам і андроіду). Може виникнути проблема з ціною розробки, так як більшість українських розробників працюють на західні ринки, де бюджети на порядок вищі ніж у нас.
Якщо потрібен бекенд (сервер) — пишеться напр. на яві (один з найдешевших варіантів) чи пітоні. Якщо просто сайт — ставте готову CMS, напр. typo3. Якщо якась гуйова програма — ті самі ява чи пітон. Так що розробку можна вести як на лінукс так і на віндовз, а тільки тестувати на лінуксі.
Якщо потрібні драйвери, то ж ніби є спільнота, яка клепає їх безплатно, якщо є специфікації заліза. :-/
