Дивно - я колись ставив Gentoo 2006.0, так так при старті живчика обирав ядро gentoo-amd64 в опціях завантаження.
В принципі, в налаштуваннях портежів (make.conf) задається архітектура (чи вже і це спростили?), типу march=k8, але збирвти 64-розрядну систему з-під 32 не пробував.
