Якщо копіюєте великі файли, тоді справді проблеми з контролером.
Якщо багато маленьких, все нормально, так і має бути (RAID3 повільніший за звичайний вінчестер при копіюванні багатьох малих файлів).
Крім того, XFS відома тим, що навантажує процесор. Це теж може стати причиною проблем.