Якщо чесно — не знаю, чому у вас так відбувається. Ніби список пакунків мав би оновлюватися...
Я б спробував змінити репо — вилучити все про mirohost та додати оце:
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial main restricted universe multiverse
deb http://archive.ubuntu.com/ubuntu xenial-updates main restricted universe
deb http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security main restricted universe multiverse
ну і знову apt-get update.