В мене ні на РХЕЛі, ні на Арчі libconfig та libconfuse і близько нема. Я, направду, вперше про них чую. Тому, якщо ви вирішите використати щось подібне, екзотичні залежності будуть. Ви, очевидно, збираєтесь вашу програму опублікувати? Пропоную такі варіанти:
1. Плодити залежності і використати бібліотеки які ви знайшли.
2. Написати свій парсер, відповідно до ваших потреб. Особисто я так би і зробив. Можна навіть видерти потрібний код із libconfig - воно по LGPL.
3. Знаю, це звучить жахливо, але, оскільки ви ще явно не визначились, що саме вам треба... XML. Парсер гарантовано є в будь-якому дистрибутиві. Але це можна розглядати лише як прийнятний варіант для програм з UI для створення конфігурації. Тільки фашисти можуть заставляти користувачів правити XML-конфіги руками.
До речі, якщо будете шукати ще якісь альтернативи... подивіться код devilspie, там чудовий формат конфігів. І парсер, фактично, готовий - бери й використовуй.