З допомогою ctags чи ptags згенерувати базу тегів. (ctags -R --languages=php -x)
Витягнути всі теги, які відносяться до функцій. (grep -w function)
Для всіх тегів функцій, починаючи з кінця (sort -nr), вставити шаблон документації перед рядочком функції ( perl -pi -le 'print "/**\ndoc\n*/" if $.==10' example.txt ).