Вся загадка була в ледачості розробників, які працюють над програмами із закритою ліцензією - вони зробили інсталятор 32-бітним, тож довелося зробити наступне:
yum install glibc.i686 libstdc++.i686
Ось так, встановив і запрацювало
Але чесно, яка не є та гарна IDE, але мені комфортніше використовувати компілятор AVR, аніж PIC. Хай і доводиться робити все через консоль, але якось комфортніше коли програма з відкритим вихідним кодом - чомусь тоді проблем немає і не доводиться доставляти масу 32-бітних дублікатів різних бібліотек.
P.S. До речі, яку IDE порадите для AVR ?