На випадок, якщо ще не надибали на цю програму, прошу познайомитись з
fdupes. Вона вже доволі стара, але не включена в усі дистрибутиви (принаймні в Slackware її нема). fdupes знаходить файли у вказаному каталозі та порівнює їхній розмір і контрольну суму MD5, видаючи потім список однакових файлів. Ось приклад використання:
fdupes -r ~/work > dupfiles.txt
(сторінку посібника надіюсь перекласти пізніше.)
Те саме засобами Bash:
find ~/work -type f -print0 | \
xargs -0 -n1 md5sum | sort --key=1,32 | \
uniq -w 32 -d --all-repeated=separate | \
sed -r 's/^[0-9a-f]*( )*//;s/([^a-zA-Z0-9./_-])/\\\1/g'
У себе знайшов їх багато після копіювання файлів з системи на іншу.