Взагалі - ніяк. бо немає достатнього критерію. апач сам відбиває, НМД вже досить.
А чим заважає?
Якщо дуже-дуже часто, що аж на DoS схоже - файрволом його... (за допомогою iptables можна регулювати, як часто з одної адреси можна звертатися до порту)
А так - воно завжди буде, по це роботи з заражених машин.