В лінуксі взагалі-то мережевий стек сам по собі дуже добре реалізований і додатково його тюнити немає потреби (ну, хіба би ви точно знали що робите і для чого). Це - одна з причин, які я мав на увазі, коли казав, що зміна MTU вам нічого не дасть.
Щодо власне швидкості. При роботі у мережі два лінукси між собою переписують файли (розумію, що не вельми об'єктивний тест, але все ж життєвий) на максимально можливих апаратних швидкостях. Зокрема ідентичні комп'ютери на ідентичних кабелях/мережевих картах/свічах показують (е, брешу - показували: вінди на них вже давно нема) приблизно 60 мбпс під віндою (smb) і десь 90 мбпс під лінуксами (ftp || nfs).