Здається сам знаю як, но щось туплю і неможу.
Запуск standalone повинен бути.
Здається у /etc/vsftpd.conf треба прописати подібне "include_..dir /etc/vsftpd_conf.d"
І туда кинути конфіг з сервером який буде крутитися на іншому порту.
Пошукав, є варіації з використанням inetd/xinetd но мені потрібен standalone запуск.
Да, і ше як там користувачі треба прописати.
21 port > ftp на /home/ftp
3337 port > ftp на /mnt/repository
оба на анонімний доступ.
vsftpd 2.0.3 debian