Скоріше за все це йому не потрібно. Навіщо очищати mbr (master boot record), якщо там нічого не встановлено? Чи таки щось встановлено?
Олег, власними словами, як можете, роскажіть що саме ви зробили, де встановили Лінукс, як завантажуєтесь у Лінукс і Віндовс (чи не можете у щось завантажитись).
Я так розумію, у вас Віндовс стоїть на "primary master" диску, a Лінукс десь або на "primary slave" або "secondary master" або "secondary slave" IDE диску. У Лінуксі це буде означати:
primary master - hda
primary slave - hdb
secondary master - hdc
secondary slave - hdd
Якщо у вас два диски, але не встановлений завантажувач систем (bootmanager англійською), тоді, напевне, поки що вам доведеться перемикати порядок дисків у BIOSі.
Я би міг вам дати тут довгу і нудну інструкцію як зробити дискету-завантажувач або як прописати Lilo або GRUB манеджер завантажень у MBR , але краще якщо ви прочитаєте як це зробити на сайті вашого дистрибутива. Принаймні, скажіть що ви встановили?