я колись мучився, щоб звук у скайпі налаштувати, доводилося pulseaudio відключати...
тепер pulseaudio є набагато стабільнішим і відсутність звуку у скайпі вже перестала бути проблемою (принаймні для мене)...
достатньо буває трохи підкорегувати налаштування мікшера і все йде чітко, у різних дистрибутивах...
ви б могли дати більше інформації про дистр, версію, стільницю (КДЕ чи ГНОМЕ), і непогано б було скіншот налаштувань мікшера...