Не вийде. debootstrap в руки, й встановлювати повністю 64-бітну систему паралельно. В чому проблема: при встановленні пакунків запускаються програми. Програми використовують бібліотеки. 32-бітна програма потребує 32-бітні бібліотеки, 64-бітна - 64-бітні. Що буде, якщо 32-бітна dpkg замінить 32-бітну glibc на 64-бітну? Жодна динамічно зібрана 32-бітна програма не запускається, скоріше за все dpkg в тому числі. Принаймні я про міграцію з архітектури на архітектуру всередині одної системи ще не чув.